Fondacija Heinrich Böll je u junu 1999. godine otvorila Regionalni ured u Sarajevu koji je zajedno sa uredima u Zagrebu i Beogradu svojim radom pokrivao Bosnu i Hercegovinu, Hrvatsku i tadašnju Saveznu republiku Jugoslaviju (Srbija, Crna Gora i Kosovo).

Ured u Sarajevu je danas nadležan za Bosnu i Hercegovinu, Sjevernu Makedoniju i Albaniju gdje sa timom od devet saradnica i saradnika uspješno nastavlja svoj rad.